Marquinhos cresceu no Tricolor. Com apenas oito anos de idade, em 2011, o jogador começou o processo de monitoramento pelo clube.
A passagem pelo CFA Laudo Natel, em Cotia, foi marcada por conquistas e convocações para as equipes de base da Seleção Brasileira, Sub-15 e Sub-17.
Em 2021, o atacante recebeu a primeira oportunidade no elenco principal e estreou no profissional, durante a disputa do Campeonato Brasileiro.
E logo no primeiro ano pela equipe, Marquinhos viveu um momento especial: decisivo, participou classificação histórica do São Paulo, em Avellaneda, diante do Racing, pelas oitavas de final da Conmebol Libertadores de 2021 – o jogador balançou as redes e teve uma grande atuação.
E, desde a chegada ao CT da Barra Funda, se tornou uma as importantes peças do sistema ofensivo são-paulino.